华为胡厚崑:中国算力网络标准需统一,硬件、应用接口、数据共享应相互兼容
480 2022-09-26
ncbi的使用教程如下:
1、首先进入NCBI主页。
Map view演示,主要是找到相关基因在染色体上的位置,以人类IL-6基因为例。点击Map View
2、选择物种,点击Go;设置filter,过滤信息;点击Genes seq查询序列
3、最后进入序列下载页面,可以直接下载。可以选择多种格式,一般选择fasta。
4、通过clone查询相关基因的cDNA序列,选择clone数据库,search基因描述。
5、对基因的蛋白质序列和mRNA查询。
6、也可对序列进行查询。基因组展示。
7、也可以查询序列信息。
8、查询已知引物,通过probe数据库搜索。
9、同源性比对blast。有多种比对方式。DNA,RNA,Protein等比对模式,排列越高表示同源性越强。也可以进行引物比对。
知识拓展
NCBI是National Center for Biotechnology Information的缩写,指美国国家生物技术信息中心,建立于1988年。
NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统。除了建有GenBank核酸序列数据库(该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库,其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构)之外,NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。