谢邀，我感觉安室透应该知道了柯南是新一，只是没有说出口。

首先在TV版里我们可以看出来安室透怀疑柯南，认为他并不是普通的小孩子，对他有很大的疑心。

一、初次怀疑柯南TV版758集【推理的波本】，怀疑柯南与沉睡的毛利小五郎的关系

二、第二次怀疑是在TV版787集【朱蒂的回忆与赏花的陷阱】，进一步怀疑柯南身份，并说“那个男的很可怕”

三、第三次怀疑就是在TV版832—836集【绯色】系列中，怀疑柯南与工藤优作的关系（ps：不过在这一集里面我们的柯南推测出了安室透的真实身份(=・ω・=)）

其次，在漫画版1008中，安室收到了朗姆发来的“收集有关工藤新一的情报”的命令。我觉得这就可能表示安室透是下一位发现柯南真实身份的人。

最后，为什么我说安室透知道柯南身份，只是没有说出口，是在剧场版22【零的执行人】中得出来的。

安室透之所以把毛利小五郎抓了起来，就是为了借助柯南的力量来破案。而且他知道，柯南最在意的是小兰。安室透对柯南说：“爱情的力量还真是伟大啊。”安室透作为毛利小五郎的弟子，对毛利家了解的很清楚，也了解小兰和工藤新一的关系。所以他这么说，也证明了自己知道柯南新一。

对于上个答案的那一句“我认识两个可怕的男人，其中有一个还只是个孩子。”这个孩子确实是指的柯南。但是并不能证明安室透真的以为柯南只是个小学生，因为对于年纪接近30的安室透来说，17岁的工藤新一确实也是个孩子。

所以，综上所述我认为安室透知道了柯南就是新一，只是没有说出口。

当然仅代表个人观点(๑•̀ㅁ•́ฅ)